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Nature:間取代苯電子等排體的不對稱合成

來源:化學加原創(chuàng)      2024-08-28
導讀:近日,美國波士頓學院(Boston College)Eranthie Weerapana與James P. Morken課題組和美國斯坦福大學(Stanford University)James K. Chen聯(lián)合報道了一種全新的鈀催化轉(zhuǎn)化,其可以將烴類衍生的前體轉(zhuǎn)化為手性含硼nortricyclanes,且這些nortricyclanes的形狀使它們可以成為間位二取代芳環(huán)的電子等排體。使用手性催化劑,此鈀催化的轉(zhuǎn)化可以以對映選擇性的方式完成,隨后通過硼的轉(zhuǎn)化可以得到廣泛的結(jié)構(gòu)。此外,作者還將nortricyclanes類化合物引入到藥物骨架中,并證明其可以有效改善生物物理性質(zhì)以及依賴于立體化學的活性。相關(guān)成果發(fā)表在Nature上,文章鏈接DOI:10.1038/s41586-024-07865-4。

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(圖片來源:Nature

正文

雖然芳香環(huán)是藥物活性化合物中的常見組成部分,但這些骨架的存在給藥物的可開發(fā)性帶來了一些不利因素。用非芳香族等排體結(jié)構(gòu)來替代芳香族結(jié)構(gòu)可以有效改善藥物的非最佳效能、代謝穩(wěn)定性、溶解度和親脂性。此外,由于芳香環(huán)是平面的且缺乏三維性,而大多數(shù)藥物靶點的結(jié)合位點是手性的。因此,所替換的電子等排體的立體化學構(gòu)型可以提供一個額外的機會,來提高衍生配體對靶受體的親和力。這種方法的一個顯著不足是缺乏從簡單易得的前體,利用簡單和可規(guī)?;拇呋侄蝸韺τ尺x擇性的合成候選電子等排體。最近,美國波士頓學院(Boston CollegeEranthie WeerapanaJames P. Morken課題組和美國斯坦福大學Stanford UniversityJames K. Chen聯(lián)合報道了新穎的鈀催化策略,將烴類衍生的前體轉(zhuǎn)化為手性含硼nortricyclanes。且將nortricyclanes引入到藥物分子骨架中可以有效改善其生物物理性質(zhì)和活性(Fig. 1)。化學加——科學家創(chuàng)業(yè)合伙人,歡迎下載化學加APP關(guān)注。

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(圖片來源:Nature

首先,作者以雙硼底物5為模板底物進行了條件篩選。實驗結(jié)果表明,當使用5(1.0 equiv),溴苯(1.5 equiv),Pd(OAc)2(2 mol%),(S,S)-L1(3 mol%),Na2CO3(1.5 equiv),在THF/H2O中反應,可以以97%的產(chǎn)率,97:3 dr得到產(chǎn)物9。在得到了最優(yōu)反應條件后,作者對此轉(zhuǎn)化的底物范圍進行了考察(Fig. 2a)。實驗結(jié)果表明簡單取代的芳基溴均可順利參與轉(zhuǎn)化,以良好的產(chǎn)率(56-97%)和對映選擇性得到相應的產(chǎn)物。其中缺電子親電試劑(11,12)和富電子親電試劑(13,15)均可順利實現(xiàn)轉(zhuǎn)化,但強吸電子的硝基芳烴親電試劑(16)產(chǎn)率有所降低。此外,雜環(huán)親電試劑同樣可以參與反應,以77-94%的產(chǎn)率得到產(chǎn)物20-23。值得一提的是,未保護的苯胺和酚似乎不會干擾該過程,并且將其擴展到非芳香族親電試劑(2425)也可實現(xiàn)轉(zhuǎn)化。

為了證明此轉(zhuǎn)化的實用性,作者進行了克級規(guī)模合成(Fig. 2b)和產(chǎn)物的合成轉(zhuǎn)化(Fig. 2c)。首先,5可以直接利用廉價的市售降冰片二烯和B2(pin)2在多克(7.3 g)規(guī)模上制備。而5的反應可以在5.0 mmol的規(guī)模上進行,只要將反應時間延長至24 h,鈀的用量僅為0.5 mol%,就可以92%的收率得到產(chǎn)物。此外,產(chǎn)物7中的硼酯可以通過鋅催化的交叉偶聯(lián)(26, 92%)、銅催化烯丙基化和羧化(27, 90%和28, 87%)、直接胺化(29, 57%)、同系化(30, 94%)或轉(zhuǎn)化為醇(31, 98%)。

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(圖片來源:Nature

機理研究提供了一種可能的途徑,可以從底物衍生的環(huán)酸鹽絡(luò)合物32中得到產(chǎn)物(Fig. 3a),此類化合物在作者先前的研究中有過報道(J. Am. Chem. Soc2022144, 17815)。作者利用DFT計算確定了鈀-烯烴絡(luò)合物(GS0)反應路徑的自由能分布,該絡(luò)合物是由LPd(0)與親電試劑發(fā)生氧化加成,隨后與32結(jié)合得到的。在一種途徑(路徑A,紅色)中,烯烴(TS1a)的碳鈀化得到Pd(II)中間體GS1a,隨后GS1a可能會被TS2a置換Pd(II),其中有機硼作為親核試劑同時釋放和還原金屬。另一種途徑中(路徑B,藍色),在與Pd(II)結(jié)合時,烯烴可能具有足夠的親電性經(jīng)歷與TS1b的親核鈀化得到GS1b,隨后經(jīng)歷直接的還原消除得到產(chǎn)物。計算結(jié)果表明,碳鈀化途徑的能量較低,且與親核鈀化步驟相比,烯烴遷移插入產(chǎn)生GS1a的能壘要低得多(0.7 kcal mol-1和18.7 kcal mol-1)。在GS1a中,溴的解離使得TS2a在19.4 kcal mol?1的能壘下發(fā)生Pd(II)的閉環(huán)還原取代(Fig. 3c)。值得注意的是,TS1a產(chǎn)生的13C動力學同位素效應的計算結(jié)果與實驗確定的結(jié)果相吻合(Fig. 3b)。值得注意的是,鈀催化5的偶聯(lián)在C2處顯示出可忽略不計的KIE,這與基于碳鈀化的機理一致,與親核鈀化途徑不一致。根據(jù)這些實驗,作者得出碳鈀化步驟是對映選擇性的決定步驟(Fig. 3d)。

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(圖片來源:Nature

為了確定nortricyclanes骨架是否適合用于生物活性分子,作者利用33的兩個對映體分別制備了脂肪酸酰胺水解酶(FAAH)抑制劑URB597的手性電子等排體類似物,并對其進行分析(Fig. 4)。值得注意的是,雖然獲得的電子等排體類似物的分子量與URB597相似,但它們在水緩沖液中的溶解度提高了10倍,同時保持了相當?shù)挠H脂性(α log D)。除此之外,通過小鼠肝微粒體測定,電子等排體類似物相對于URB597表現(xiàn)出明顯增加的代謝穩(wěn)定性。接下來,作者通過定量活性的蛋白質(zhì)譜實驗比較了化合物(R,S)-33和(S,R)-33。雖然實驗結(jié)果表明(R,S)-33和(S,R)-33的抑制作用不如URB597,但這兩種電子等排體類似物仍然具有抑制FAAH的能力,并且表現(xiàn)出不同的抑制作用。

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(圖片來源:Nature


總結(jié)

James K. Chen、Eranthie Weerapana James P. Morken課題組聯(lián)合發(fā)展了催化對映選擇性nortricyclanes合成方法,為手性間位取代苯生物電子等排體的合成提供了有效途徑。該催化合成方法的簡單性和穩(wěn)健性,結(jié)合nortricyclanes類化合物的生物物理性質(zhì),為藥物開發(fā)提供了新的機會。預計這些簡單、廉價的官能團化nortricyclanes骨架的合成,將為新的生物活性物質(zhì)的研發(fā)奠定基礎(chǔ)。

文獻詳情:

Catalytic asymmetric synthesis of meta benzene isosteres. 
Mingkai Zhang, Matthew Chapman, Bhagyesh R. Sarode, Bingcong Xiong, Hao Liang, James K. Chen*,Eranthie Weerapana*, James P. Morken*
Nature, 2024,
https://doi.org/10.1038/s41586-024-07865-4.

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