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Angew熱點(diǎn)文章&封底!大連理工大學(xué)環(huán)境學(xué)院在功能核酸篩選和應(yīng)用領(lǐng)域取得重要進(jìn)展

來(lái)源:      2020-05-09
導(dǎo)讀:功能核酸,如核酸適配體是一種通過(guò)體外篩選技術(shù)(SELEX)獲得的具有識(shí)別功能的核酸分子,由于具有化學(xué)穩(wěn)定性高、親和力高和生產(chǎn)成本低等特點(diǎn),已成為當(dāng)前生物分析和生物醫(yī)學(xué)研究中重要的智能生物工具。

功能核酸,如核酸適配體是一種通過(guò)體外篩選技術(shù)(SELEX)獲得的具有識(shí)別功能的核酸分子,由于具有化學(xué)穩(wěn)定性高、親和力高和生產(chǎn)成本低等特點(diǎn),已成為當(dāng)前生物分析和生物醫(yī)學(xué)研究中重要的智能生物工具。適配體可識(shí)別的靶標(biāo)分子范圍廣泛,對(duì)于蛋白質(zhì)分子,不管是純化的可溶性蛋白,還是位于細(xì)胞表面的復(fù)雜蛋白都可以做為適配體的靶標(biāo)分子,但前提是這些靶標(biāo)蛋白必須具有天然穩(wěn)定的構(gòu)象。但是對(duì)于臨床樣本(血液、尿液或糞便)中的蛋白質(zhì),由于受到水解、氧化和pH變化等影響可能發(fā)生降解,從而大大降低適配體的特異性結(jié)合能力。

以艱難梭菌(Clostridium difficile)為例,艱難梭菌是引起抗菌藥物相關(guān)性腹瀉和偽膜性結(jié)腸炎的主要致病菌,致病性主要是由于其產(chǎn)生的毒素A和毒素B (TcdA和TcdB)會(huì)與腸上皮細(xì)胞的糖蛋白結(jié)合,破壞腸道屏障,最終導(dǎo)致急性炎癥和腹瀉。由于抗生素的廣泛大量使用,艱難梭菌感染已經(jīng)對(duì)全球健康造成了嚴(yán)重威脅。這些毒素排出人體后,由于生理?xiàng)l件等改變,會(huì)自發(fā)降解成蛋白小片段或肽鏈,給臨床診斷艱難梭菌感染帶來(lái)了巨大挑戰(zhàn)。因此建立準(zhǔn)確、快速的診斷方法對(duì)于控制艱難梭菌感染至關(guān)重要。

針對(duì)以上難點(diǎn),大連理工大學(xué)劉猛課題組首先開(kāi)發(fā)了新型核酸適配體體外篩選方法,得到了可以識(shí)別毒素B降解片段(DN-toxin B)的適配體,兩者的結(jié)合能力在nM級(jí)別。此外,該適配體可以結(jié)合天然毒素B(FN-toxin B)和熱處理的毒素B(TN-toxin B),對(duì)于重組型毒素B(R-toxin B)、毒素A(toxin A)和谷氨酸脫氫酶(GDH)等表現(xiàn)出良好的選擇性。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),適配體識(shí)別的毒素B降解片段的分子量在50 kDa左右。

在此基礎(chǔ)上,發(fā)展了一種簡(jiǎn)便的微流控紙分析器件,實(shí)現(xiàn)了糞便樣品中艱難梭菌的可視化檢測(cè),與商業(yè)化的檢測(cè)試劑盒相比,該器件在較短的時(shí)間內(nèi)可以達(dá)到更高的靈敏度。對(duì)于流行菌株NAP1,該器件在30分鐘內(nèi)可以檢測(cè)到104個(gè)細(xì)菌。

該成果在線發(fā)表于Angewandte Chemie International Edition,并被選為當(dāng)期熱點(diǎn)文章(hot paper)和封底文章(back cover)。大連理工大學(xué)環(huán)境學(xué)院為論文第一通訊單位,加拿大McMaster大學(xué)生物界面研究所John D. Brennan教授和生物化學(xué)和生物醫(yī)學(xué)系Yingfu Li教授為文章的共同通訊作者。

論文信息:

In Vitro Selection of A DNA Aptamer Targeting Degraded Protein Fragments for Biosensing. Angew. Chem. Int. Ed., 2020, 59, 7706-7710.


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