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清華化工系戈鈞課題組合作發(fā)文報道基于酶催化的細(xì)胞內(nèi)代謝物原位檢測新方法

來源:清華新聞網(wǎng)      2019-11-20
導(dǎo)讀:11月14日,清華大學(xué)化工系戈鈞課題組與中國科學(xué)院過程所魏煒研究員、天津大學(xué)張麟教授、清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院研究員李賽合作在《自然·通訊》(Nature Communications)發(fā)表文章《無定形金屬有機骨架用于酶的裝載和遞送》(Packaging and delivering enzymes by amorphous metal-organic frameworks),報道了采用無定形金屬有機骨架材料進行酶分子包埋,構(gòu)建高效酶催化劑的新方法。包埋于無定形金屬有機骨架結(jié)構(gòu)中的酶分子具有很好的催化活性和穩(wěn)定性,無定形金屬有機骨架納米載體將酶分子遞送進細(xì)胞,在細(xì)胞內(nèi)進行生物催化反應(yīng),在目標(biāo)代謝物的催化轉(zhuǎn)化過程中產(chǎn)生熒光信號,實現(xiàn)了活細(xì)胞內(nèi)代謝物的單細(xì)胞水平原位檢測。

細(xì)胞內(nèi)重要的代謝物變化與很多疾病的發(fā)生有著密切的關(guān)系,細(xì)胞內(nèi)目標(biāo)代謝物的檢測對細(xì)胞代謝基礎(chǔ)研究和疾病早期診斷具有重要意義。簡便易操作并且適用性廣的單細(xì)胞水平的胞內(nèi)代謝物的靈敏檢測技術(shù)在重大疾病比如癌癥的早期診斷及預(yù)后監(jiān)測、慢性病的健康管理等方面具有廣闊的應(yīng)用前景。

該工作提出基于酶催化的細(xì)胞內(nèi)代謝物原位檢測新方法,利用酶催化對底物的專一性和高效性實現(xiàn)對目標(biāo)代謝物分子的高選擇性轉(zhuǎn)化,產(chǎn)生可檢測的熒光信號;理論上該方法可以針對不同目標(biāo)代謝物設(shè)計特定的酶催化反應(yīng)進行檢測,具有很好的普適性。該方法的關(guān)鍵是將酶分子遞送進細(xì)胞后如何保持酶催化劑在胞內(nèi)環(huán)境中的高活性和良好的穩(wěn)定性。戈鈞課題組前期工作提出一步共沉淀法將酶分子包埋于無機晶體、金屬有機骨架晶體中,利用載體微環(huán)境的限域效應(yīng)、鄰近效應(yīng)等增強酶催化劑在人工應(yīng)用環(huán)境下的穩(wěn)定性以及酶-金屬耦合催化的總效率,利用缺陷效應(yīng)提高金屬有機骨架晶體中酶催化的表觀活性,開發(fā)了基于化學(xué)工程和納米技術(shù)手段改造酶催化劑的新途徑。

在此基礎(chǔ)上,本研究進一步利用缺陷工程方法,在一步共沉淀法制備酶-金屬有機骨架復(fù)合物的過程中,調(diào)控有機配體濃度,產(chǎn)生大量金屬離子和有機配體間的配位缺陷。通過掃描電鏡、超分辨熒光、X射線衍射、X射線吸收精細(xì)結(jié)構(gòu)譜、分子動力學(xué)模擬等手段相結(jié)合,該研究發(fā)現(xiàn)配位缺陷使得金屬有機骨架在形成過程中喪失了長程有序結(jié)構(gòu),發(fā)生了由晶態(tài)向無定形狀態(tài)的轉(zhuǎn)變,酶分子被包埋在100nm左右的粒徑均一的無定形載體中。分子模擬發(fā)現(xiàn)無定形金屬有機骨架載體中出現(xiàn)大量3-6nm的介孔,氮氣吸附實驗確認(rèn)了載體中介孔的存在,冷凍電鏡斷層成像技術(shù)則直接觀察到了酶-無定形金屬有機骨架復(fù)合物中大量存在的貫穿介孔,而相應(yīng)的晶態(tài)復(fù)合物中僅存在1nm左右的微孔。通過載體中的酶催化反應(yīng)-擴散模型的理論計算,該研究發(fā)現(xiàn)晶態(tài)復(fù)合物中1nm左右的微孔限制了酶的底物分子在載體中的傳質(zhì),從而嚴(yán)重降低了酶催化劑的表觀活性。而酶-無定形金屬有機骨架復(fù)合物中,大量3-6nm的貫穿介孔有利于底物分子的傳質(zhì),酶催化劑的表觀活性比晶態(tài)提高5~20倍,接近于天然狀態(tài)酶的活性。同時,載體的限域包埋提高了酶催化劑在高溫、蛋白酶等苛刻條件下的穩(wěn)定性。 

圖1. 無定形金屬有機骨架納米顆粒(a)以及酶-無定形金屬有機骨架復(fù)合物(b)的掃描電鏡圖;(c)酶-無定形金屬有機骨架復(fù)合物的超分辨熒光顯微鏡;(d)X-射線衍射;(e)X-射線吸收精細(xì)結(jié)構(gòu);(f)分子動力學(xué)模擬孔徑;(g)氮氣吸附實驗并通過NLDFT模型計算的孔徑分布;(h)冷凍電子斷層成像術(shù)直觀觀察到的酶-無定形金屬有機骨架復(fù)合物介孔;(i)包埋酶的表觀酶活性。

粒徑均一的100nm左右的無定形金屬有機骨架載體將包埋其中的酶分子通過胞吞作用遞送進入細(xì)胞,酶催化劑在載體保護下在胞內(nèi)具有良好的活性和穩(wěn)定性,催化目標(biāo)代謝物反應(yīng)產(chǎn)生熒光信號。以胞內(nèi)葡萄糖檢測為例,基于熒光信號強度,該方法可以很簡便實現(xiàn)活細(xì)胞內(nèi)葡萄糖濃度的原位準(zhǔn)確測定,并且與傳統(tǒng)的細(xì)胞裂解檢測方法的結(jié)果一致。更為重要的是,該方法可以實現(xiàn)單細(xì)胞水平的檢測,很好地避免了傳統(tǒng)細(xì)胞裂解檢測方法的濃度平均化問題。進一步地,本研究中基于腫瘤細(xì)胞的“瓦博格效應(yīng)”(Warburg effect),利用酶-無定形金屬有機骨架復(fù)合物檢測出了多種癌細(xì)胞內(nèi)葡萄糖濃度顯著高于正常細(xì)胞,可以用于癌細(xì)胞和正常細(xì)胞的區(qū)分,為開發(fā)癌癥液態(tài)活檢技術(shù)提供了新思路。 

圖2. 肝癌細(xì)胞和正常肝細(xì)胞的熒光強度變化圖(a)以及對應(yīng)的共聚焦系統(tǒng)圖像(b);(c)不同細(xì)胞胞內(nèi)葡萄糖濃度和檢測熒光強度的關(guān)系;各細(xì)胞熒光強度達到峰值時的細(xì)胞圖像(d)。

清華大學(xué)化工系吳曉玲博士(現(xiàn)為華南理工博士后)、中國科學(xué)院過程所副研究員岳華和清華大學(xué)化工系博士生張原宇為本文共同第一作者,清華大學(xué)化工系長聘副教授戈鈞、中國科學(xué)院過程所研究員魏煒、天津大學(xué)化工學(xué)院張麟教授和清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院研究員李賽為本文共同通訊作者。清華大學(xué)為第一完成單位。該研究得到國家重點研發(fā)計劃納米科技重點專項青年項目、國家自然科學(xué)基金優(yōu)秀青年基金、北京自然科學(xué)基金杰出青年基金等項目的資助。

論文鏈接:

https://www.nature.com/articles/s41467-019-13153-x


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