
軸手性分子作為一類優(yōu)勢骨架,在天然產(chǎn)物、藥物化學、不對稱催化及材料科學等多個研究領(lǐng)域展現(xiàn)出廣闊的應用前景。除最為常見的聯(lián)芳基軸手性結(jié)構(gòu)外,非聯(lián)芳基類阻轉(zhuǎn)異構(gòu)體,如酰胺、苯乙烯、苯胺及酰亞胺等化合物,因其獨特的軸向手性以及多樣化的功能,近年來受到廣泛關(guān)注(圖1A)。其中,芳基酰胺類化合物因Caryl–Camide鍵的旋轉(zhuǎn)受限而表現(xiàn)出穩(wěn)定的軸手性,在生物活性分子的構(gòu)建及不對稱催化等領(lǐng)域具有重要應用價值。然而,該類軸手性芳基酰胺的不對稱催化合成策略仍不夠成熟,其主要挑戰(zhàn)在于Caryl–Camide鍵的旋轉(zhuǎn)能壘相對較低,使得該手性軸的立體化學控制與構(gòu)型保持變得尤為困難。
近年來,生物催化在構(gòu)建軸手性分子領(lǐng)域取得顯著進展,多種酶催化劑—從傳統(tǒng)脂肪酶、酮還原酶到亞胺還原酶、烯烴還原酶、細胞色素P450乃至人工金屬酶—已被成功應用于軸手性分子的不對稱合成。然而,現(xiàn)有研究多集中于經(jīng)典的聯(lián)芳基骨架體系,針對軸手性酰胺的酶催化構(gòu)建方法仍無報道(圖1B)。
近日,中國醫(yī)學科學院/北京協(xié)和醫(yī)學院醫(yī)藥生物技術(shù)研究所付海根課題組與宋丹青課題組合作,利用亞胺還原酶(IREDs)催化的動態(tài)動力學拆分策略,首次實現(xiàn)了軸手性芳基酰胺類分子的酶催化不對稱合成。該DKR過程包含兩個關(guān)鍵步驟:首先,鄰位含有醛基的芳香酰胺底物(rac-4a)可借助酰胺氮原子的孤對電子與醛基之間產(chǎn)生n→π相互作用,有效降低手性軸的旋轉(zhuǎn)能壘,促使底物快速消旋;隨后,IREDs通過高度立體選擇性地還原其中一種亞胺對映體,最終高效生成光學純的芳香酰胺類軸手性產(chǎn)物(圖1C)。

圖1. 生物催化合成芳基酰胺類化合物。圖片來源:J. Am. Chem. Soc.
作者首先以消旋萘甲酰胺醛4a與芐胺5a作為模板底物,對一系列野生型亞胺還原酶(IREDs)進行篩選,發(fā)現(xiàn)來源于Kutzneria albida的IRED-68雖在初步篩選中活性較低(產(chǎn)率10%),但對目標產(chǎn)物表現(xiàn)出優(yōu)異的立體選擇性(96:4 er)。為進一步提升催化效率,研究團隊解析了IRED-68的蛋白晶體結(jié)構(gòu),并基于結(jié)構(gòu)信息對其活性中心的13個關(guān)鍵殘基進行了迭代飽和突變,最終獲得四重突變體 IRED-68-M4(V123Q/S233G/V232H/A122T)。該突變體相較于野生型蛋白,比活性提高了135倍。在后續(xù)反應優(yōu)化中,采用粗酶凍干粉(4 mg/mL)并添加表面活性劑TPGS-750-M(2 wt%),模型反應的產(chǎn)率可提高至94%,對映選擇性達到99:1 er。

圖2. 模板反應篩選與優(yōu)化。圖片來源:J. Am. Chem. Soc.
隨后,作者對突變體IRED-68-M4的底物適用范圍進行了系統(tǒng)評估(圖3)。結(jié)果表明,該突變體具有良好的底物兼容性,可高效催化多種取代芐胺、雜環(huán)取代甲胺、苯乙胺及苯胺等胺類底物。除萘甲酰胺(6–36)結(jié)構(gòu)外,該酶對苯甲酰胺衍生物(37–40)也表現(xiàn)出較高催化活性,多數(shù)底物可獲得70%–98%的產(chǎn)率,并保持優(yōu)異的對映選擇性(最高er > 99:1)。此外,研究團隊成功實現(xiàn)了化合物10的克級規(guī)模制備,以84%的產(chǎn)率獲得1.28 g目標產(chǎn)物(98:2 er),進一步證明了該方法在合成應用中的潛力。

圖3. 底物范圍拓展。圖片來源:J. Am. Chem. Soc.
最后,作者結(jié)合X射線晶體學與分子對接分析,揭示了IRED-68-M4突變體催化性能提升的機制。研究發(fā)現(xiàn),突變位點V123Q可與還原型輔因子NADPH的煙酰胺環(huán)形成額外氫鍵,從而可能增強與輔因子的結(jié)合能力。ITC結(jié)合實驗進一步證實,突變體IRED-68-M4對NADPH的結(jié)合能力顯著高于野生型IRED-68-WT(KD = 4.1 μM vs. 27.4 μM)。分子對接結(jié)果表明,V232H位點可與亞胺底物42的苯環(huán)產(chǎn)生π–π相互作用,而S233G位點則擴大了活性中心空腔,有利于大體積底物的結(jié)合與進入。此外,通過單位點突變實驗,作者鑒定出D170為潛在的質(zhì)子給體(圖4)。

圖4. 結(jié)構(gòu)及機理解析。圖片來源:J. Am. Chem. Soc.
總結(jié)
本研究基于動態(tài)動力學拆分策略,首次實現(xiàn)了軸手性芳基酰胺類分子的生物催化不對稱合成。通過高效的蛋白質(zhì)工程改造,成功獲得了催化性能優(yōu)異的IRED-68-M4突變體,該酶兼具高活性、高對映選擇性及廣泛的底物適用性,為構(gòu)建非聯(lián)芳基軸手性分子提供了新型酶催化工具。該研究成果發(fā)表于J. Am. Chem. Soc.,中國醫(yī)學科學院/北京協(xié)和醫(yī)學院醫(yī)藥生物技術(shù)研究所博士研究生姚周暢和孟潤澤為本文共同第一作者;黃玲博士、宋丹青研究員、付海根研究員為共同通訊作者。研究過程中,楊兆勇課題組為本工作提供了重要支持。
原文鏈接
Zhouchang Yao, Runze Meng, Zitian Zhou, Luyao Yu, Zhiyun Wu, Longqing Tang, Tianzhang Qiao, Ke Li, Ling Huang,* Danqing Song,* Haigen Fu.*Engineering an Imine Reductase for Enantioselective Synthesis of Atropisomeric Amides. J. Am. Chem. Soc., 2025, https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.5c12724.
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付海根,現(xiàn)任中國醫(yī)學科學院/北京協(xié)和醫(yī)學院醫(yī)藥生物技術(shù)研究所研究員,主要從事生物催化與藥物化學研究。近年來以第一或通訊作者在Nature、Nature Catalysis、JACS、Angewandte Chemie等國際高水平期刊發(fā)表論文十余篇,并于2022年入選國家高層次青年人才計劃。
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