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Science:銅取代非血紅素酶催化的芐位 C(sp3)-N 對映匯聚偶聯(lián)反應(yīng)

來源:化學(xué)加原創(chuàng)      2025-08-20
導(dǎo)讀:近日,美國約翰霍普金斯大學(xué)(Johns Hopkins University)Xiongyi Huang,浙江工業(yè)大學(xué)(Zhejiang University of Technology)楊云芳以及美國猶他州立大學(xué)(Utah State University)Yi Rao課題組聯(lián)合開發(fā)了一種光生物催化新方法,作者利用銅取代的非血紅素酶實現(xiàn)了芐位C(sp3)-N自由基偶聯(lián)。通過使用羅丹明B作為光氧化還原催化劑,作者發(fā)現(xiàn)銅取代的苯丙氨酸羥化酶能催化N-羥基鄰苯二甲酰亞胺酯與苯胺的對映收斂性脫羧胺化反應(yīng)。經(jīng)定向進(jìn)化改造活性位點后,該體系對多數(shù)底物展現(xiàn)出高對映選擇性。基于分子模擬與機(jī)理研究,作者提出酶活性中心可容納銅-苯胺復(fù)合物與芐位自由基反應(yīng)的機(jī)制。文章鏈接DOI:10.1126/science.adt5986。

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(圖片來源:Science


正文

C(sp3)-N鍵廣泛存在于生物活性分子、藥物和功能材料中,因此C(sp3)-N鍵的構(gòu)建是有機(jī)合成中不可或缺的合成過程。在過去十年中,銅催化自由基C(sp3)-N偶聯(lián)成為該領(lǐng)域的主導(dǎo)合成策略。與此同時,生物催化C(sp3)-N鍵構(gòu)建技術(shù)在過去20年快速發(fā)展,通過對轉(zhuǎn)氨酶、亞胺還原酶等的改造,以及將非天然反應(yīng)機(jī)制引入酶體系,實現(xiàn)了諸如立體選擇性C(sp3)-H鍵胺化、烯烴氫胺化等挑戰(zhàn)性反應(yīng)。將銅催化自由基偶聯(lián)與生物催化相結(jié)合,可兼具酶的選擇性與銅催化的反應(yīng)性,為傳統(tǒng)方法難以實現(xiàn)的催化胺化反應(yīng)提供新思路。其中,脫羧胺化因其能將豐富羧酸轉(zhuǎn)化為胺類而極具價值。盡管銅催化體系已取得一定的進(jìn)展,但實現(xiàn)對映收斂的脫羧C(sp3)-N偶聯(lián)仍存在很大挑戰(zhàn)。最近,美國約翰霍普金斯大學(xué)Xiongyi Huang,浙江工業(yè)大學(xué)楊云芳以及美國猶他州立大學(xué)Yi Rao課題組合作開發(fā)了光生物催化新方法,利用銅取代的非血紅素酶的手性環(huán)境以及定向進(jìn)化技術(shù),高對映選擇性的實現(xiàn)了芐位C(sp3)-N自由基偶聯(lián)(Fig. 1)歡迎下載化學(xué)加APP到手機(jī)桌面,合成化學(xué)產(chǎn)業(yè)資源聚合服務(wù)平臺。

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(圖片來源:Science

基于上述理論基礎(chǔ),作者首先構(gòu)建了非血紅素酶庫進(jìn)行初篩。通過模擬評估多種非血紅素酶活性位點對苯胺和模型底物NHPI酯1a的容納潛力,從中篩選出8種具有適宜活性位點環(huán)境的酶。以NHPI酯1a為底物、苯胺2b為胺偶聯(lián)配偶體、羅丹明B為光催化劑,在過量Cu(II)存在下進(jìn)行脫羧胺化測試。結(jié)果顯示,僅苯丙氨酸羥化酶(CvPAH)表現(xiàn)出初始活性,能以1.1%產(chǎn)率和10%對映體過量(ee)生成目標(biāo)產(chǎn)物。進(jìn)一步評估發(fā)現(xiàn),N-甲基苯胺2a的活性優(yōu)于苯胺2b(產(chǎn)率1.5%,ee值16%),而烷基胺、酰胺及磺酰胺類均無反應(yīng)活性。對照實驗表明,去除酶催化劑或用牛血清白蛋白(BSA)替代CvPAH時僅得到外消旋產(chǎn)物;鐵、鈷、鎳等金屬僅產(chǎn)生痕量產(chǎn)物,凸顯出銅在該轉(zhuǎn)化中的不可替代性。

在獲得初始活性后,作者們通過定向進(jìn)化改造CvPAH。該酶屬于蝶呤依賴型芳香族氨基酸羥化酶家族(AAAHs),其活性位點包含四氫生物蝶呤(BH4)輔因子結(jié)合域和柔性底物結(jié)合環(huán)(Fig. 2A)。結(jié)合CvPAH與銅-N-甲基苯胺復(fù)合物的分子動力學(xué)模擬,作者選擇20個活性位點殘基進(jìn)行飽和突變(SSM)篩選。采用GC-MS初篩結(jié)合手性HPLC立體選擇性驗證的策略,優(yōu)先保留ee值提升的突變體。在進(jìn)化工程啟動前,實驗室已有突變體庫篩選獲得F107L/Y130P雙突變體,其ee值提升至66%。以此為母本進(jìn)行多輪SSM篩選,最終獲得五重突變體CvPAH F107L/Y130S/W180A/P134L/Y179W(簡稱CvPAH-胺化酶),能以19%產(chǎn)率和94% ee值生成產(chǎn)物3a(Fig. 2B)。分子模擬顯示,突變導(dǎo)致活性腔體積擴(kuò)大1.4倍,形成單一擴(kuò)增空腔更利于底物1a的容納(Fig. 2C)。

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(圖片來源:Science

在獲得最終變體后,作者通過優(yōu)化反應(yīng)參數(shù)提高了產(chǎn)率。質(zhì)譜分析表明,80%的NHPI酯1a通過氧化還原活化消耗,但僅16%轉(zhuǎn)化為目標(biāo)胺化產(chǎn)物。系統(tǒng)優(yōu)化顯示羅丹明B是最佳光催化劑,銅離子濃度過高會降低蛋白質(zhì)穩(wěn)定性。最終確立的最優(yōu)條件為:1.25 mM硫酸銅、5.0 mM抗壞血酸、10 mM N-甲基苯胺、45 mM NHPI酯1a和100 μM羅丹明B,使用OD600 = 50的全細(xì)胞裂解液時,在4 oC下反應(yīng)6-24小時,產(chǎn)物3a收率達(dá)92%,對映選擇性為94% ee。對照實驗證實CvPAH酶的關(guān)鍵作用,且粗酶液效果優(yōu)于純化蛋白。

底物拓展研究表明,NHPI酯芳環(huán)上的取代基顯著影響反應(yīng)效率(Fig. 3):對位異丁基導(dǎo)致產(chǎn)率和對映選擇性下降(3f),芐位修飾產(chǎn)生明顯差異(3g-3i),非芐基羧酸衍生物無反應(yīng)活性(1b)。以1a為模型底物時,苯胺類胺化偶聯(lián)部分的耐受性較好(產(chǎn)率 > 40%,ee > 90%),但芐胺會完全抑制反應(yīng)并生成酰胺副產(chǎn)物5。該策略還可兼容四氯-N-羥基鄰苯二甲酰亞胺酯9(產(chǎn)率60%,ee 90%)和Katritzky鹽等自由基前體。此外,肟酯6則產(chǎn)生開環(huán)胺化產(chǎn)物7(產(chǎn)率5.1%,ee 42%)。雖然烷基胺適用性有限,但這些發(fā)現(xiàn)證明了CvPAH平臺與多種自由基生成策略結(jié)合的潛力(Fig. 3)。

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(圖片來源:Science

最后,作者通過一系列實驗深入探究了這種光生物催化脫羧胺化反應(yīng)的機(jī)理(Fig. 4)。研究發(fā)現(xiàn),無論是外消旋還是手性NHPI底物,酶都能將其有效轉(zhuǎn)化為非手性底物構(gòu)建C-N鍵,且產(chǎn)物對映體過量始終保持在94% ee。自由基捕獲實驗和環(huán)丙基自由基鐘底物實驗證實了碳中心自由基的參與。熒光光譜分析表明,光激發(fā)態(tài)RhB*與抗壞血酸鹽(AH?)之間最可能發(fā)生初始單電子轉(zhuǎn)移,生成的RhB??進(jìn)一步將CvPAH中的Cu(II)還原為Cu(I)。色氨酸熒光淬滅實驗顯示CvPAH-胺化酶對Cu2+的結(jié)合親和力(K= 2.52 μM)弱于野生型(Kd  = 0.48 μM),且對6-生物蝶呤的結(jié)合能力也降低。關(guān)鍵突變研究表明,179位和180位殘基對維持酶活性和立體選擇性具有協(xié)同作用,且W179A突變使產(chǎn)率從92%降至8%,ee值從94%降至10%;而A179/W180雙突變則幾乎完全喪失酶活性。這些發(fā)現(xiàn)為理解該光酶催化體系的反應(yīng)機(jī)制提供了重要依據(jù),但關(guān)于自由基生成位點等具體機(jī)制仍需通過瞬態(tài)吸收光譜等進(jìn)一步研究闡明。

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(圖片來源:Science


總結(jié)

Xiongyi Huang,楊云芳和Yi Rao課題組提出了一種脫羧形成C?N鍵的生物催化新策略,證實了多環(huán)芳烴羥化酶(PAHs)可作為對映選擇性自由基C?N成鍵的強(qiáng)大催化平臺。首次實現(xiàn)了酶催化的自由基C(sp3)?N偶聯(lián)反應(yīng),填補(bǔ)了生物催化與合成催化之間的空白。通過將該金屬酶平臺與不同自由基生成機(jī)制相結(jié)合,有望實現(xiàn)多種自然界尚未發(fā)現(xiàn)的生物催化胺化反應(yīng)。

文獻(xiàn)詳情:

Enantioconvergent benzylic C(sp3)?N coupling with a copper-substituted nonheme enzyme.
Xuzhong Shen, Xiahe Chen, Yihang Xiao, Jesse B. Brown, James G. Zhang, Xinyuan Ji, Jinyan Rui, Marc Garcia-Borràs, Yi Rao*, Yunfang Yang*, Xiongyi Huang*. 
Science, 2025, 389741-746
https://www. science.org/doi/10.1126/science.adt5986
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