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北大余志祥課題組在對稱C···H···C氫鍵的理論預(yù)測方面取得新進展

來源:北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院      2020-02-27
導(dǎo)讀: 最近,余志祥教授和研究助理王熠博士通過理論計算首次提出了對稱C···H···C氫鍵存在的可能性。該工作發(fā)表在J. Org. Chem. 2020, 85, 397。

氫鍵在物理、化學(xué)、生命科學(xué)和材料科學(xué)等自然科學(xué)中的重要性不言而喻。科學(xué)家在研究氫鍵的時候經(jīng)常會涉及到氫鍵對稱性的問題。在對稱氫鍵中,質(zhì)子處于兩個相同的離子、分子或分子片的正中央,勢能面上僅存在一個勢阱(圖1a;左)。對于非對稱X?H···X氫鍵,雙勢阱勢能面中的對稱結(jié)構(gòu)為過渡態(tài)(圖1a;右)。圖1b中給出了一些對稱氫鍵的例子:對稱N···H···N氫鍵存在于質(zhì)子化1,6-二氮雜雙環(huán)[4.4.4]十四烷(1)中;對稱O···H···O氫鍵存在于馬來酸氫鹽(2)中;對稱F···H···F氫鍵存在于氟氫化物中??紤]到CN、O、F同周期且其電負性比H強,從理論上講,對稱C···H···C氫鍵也是有可能存在的。但是,文獻中卻鮮有關(guān)于對稱C···H···C氫鍵的實驗或理論研究。

 

1.        a)氫鍵的對稱性;(b)對稱氫鍵示例。

 

        最近,余志祥教授和研究助理王熠博士通過理論計算首次提出了對稱C···H···C氫鍵存在的可能性。作者首先以甲烷與甲基負離子所形成的氫鍵復(fù)合物為例論證了對稱C···H···C氫鍵存在的理論基礎(chǔ)。如圖2所示,當兩個碳原子之間的距離被固定為2.90 ?時,體系展現(xiàn)出了雙勢阱勢能面的特征。隨著兩個碳原子不斷靠近,勢能面逐漸由雙勢阱向單勢阱過渡。最終,當兩個碳原子之間的距離被縮短至2.50 ?時,體系中首次出現(xiàn)了對稱的碳氫碳氫鍵。

 

2.        勢能面掃描。

 

        然而,在上述例子中具有對稱氫鍵的結(jié)構(gòu)并不是體系的能量極小點。因此,接下來他們開始著手于利用理論計算設(shè)計一些更加合理的對稱C···H···C氫鍵。為了將兩個碳原子之間的距離固定在2.5 ?附近,作者參考了質(zhì)子化1,6-二氮雜雙環(huán)[4.4.4]十四烷(1;其結(jié)構(gòu)如圖1b所示)中的對稱N···H···N氫鍵。在該結(jié)構(gòu)中,兩個氮原子之間的距離為2.53 ?。他們試圖通過設(shè)計分子內(nèi)C···H···C氫鍵,并利用環(huán)張力強迫兩個碳原子靠近(圖3;左)。但是,這一策略并未取得成功。經(jīng)過幾何優(yōu)化,作者發(fā)現(xiàn)體系能量極小點中的C?H···C氫鍵是非對稱的,且兩個碳原子之間的距離長達2.93 ?。為了進一步縮短兩個碳原子之間的距離,作者通過引入籠狀結(jié)構(gòu)(例如桶烯)進一步增加了體系的環(huán)張力。如圖3(右)所示,此時體系能量極小點中兩個碳原子之間的距離僅為2.53 ?,且C···H···C氫鍵是對稱的。至此,作者成功例證了對稱C···H···C氫鍵存在的可能性。

 

3.        非對稱C?H···C氫鍵(左)和對稱C···H···C氫鍵(右)。

 

        最后,作者對合成該碳負離子的途徑進行了理論研究。如圖4所示,由烴類前體11到目標碳負離子7的轉(zhuǎn)化在熱力學(xué)上是可行的。這意味著(至少在氣相中)烴類前體11具有比水分子更強的酸性。同時,這些反應(yīng)的活化能均不高(小于20 kcal/mol),這意味著目標碳負離子7有機會在較為溫和的反應(yīng)條件下被合成出來?;谶@些正面的初步結(jié)果,作者期望合成化學(xué)家能夠在不久的將來設(shè)計出更加合理的反應(yīng)前體,并在實驗上成功實現(xiàn)對稱C···H···C氫鍵的構(gòu)筑。該工作發(fā)表在J. Org. Chem. 202085, 397。 以上工作在X-Mol上也有相關(guān)介紹(https://www.x-mol.com/news/158535)。

 

4.        由烴類前體11轉(zhuǎn)化為碳負離子7的勢能面。


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